教育部表示，各系所領域與專業特性有所不同，碩博士論文指導工作亦有差異，大學教授指導學生論文篇數，應在兼顧學術要求及指導品質下為之；學校也應積極強化學位論文品保及指導教授課責機制，以維學術專業發展。
查詢「台灣博碩士論文知識加值系統」，賀力行擔任指導教授總計473筆，最早指導論文在1992年，前6年指導學生都是個位數，從2011到2018年大爆發，每年幾乎都是近30人。賀力行桃李滿天下，除了「傑出校友」林智堅，還有新竹縣長楊文科、縣府秘書長陳季媛、機要秘書池燕雲、竹市前市議員鄭貴元等人也都由賀指導。
不過，文化大學大傳系教授王翔郁說，近年來教育政策引導學校進行產官學合作，不少教授是靠人際脈絡的營造而有拿不完的案子，成為政學界特殊的合作模式；通常一位老師指導研究生，1年3至5人是上限，歴任科技部長均為國際知名學者，例如張善政指導47人、徐爵民26人、楊弘敦68人、陳良基191人、吳政忠104人，「加起來還沒有賀力行一個人多」，恐難保持一定的學術品質。
高雄大學政治法律系教授廖義銘說，論文門現象的背後，其實是在職生的入學為學校及學者帶進充沛的政商資源，形成「產官學互養」現象。台藝大廣電系教授賴祥蔚說，一位副教授指導473位研究生，他和台大、政大的教授們聊起都自嘆不如，不知如何品管？
中華大學副校長解鴻年說，教授指導碩博士生人數由各系規定，上限各有不同，他任教建築系，1年指導不超過兩人。賀力行去年已退休，原本任教的科技管理系設有在職專班，因學生數多，每年收的指導學生當然也相對多，其他國立大學若有開設碩專班也是如此，1年指導學生也可能有兩位數。
民進黨立委鄭運鵬表示，不要用台北觀點瞧不起地區大學，楊文科也是賀力行學生，還是比林智堅更早的學生，當時楊還是科學園區更早的文官，難道是指控楊一直在圖利賀力行和中華大學嗎？
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